Und nun meine ich zu wissen, was genau dein Problem war...
Im Android Adressbuch hast du die Anzeige der Threema IDs aktiviert gehabt, die dir auch die in Threema selbst versteckten IDs anzeigt und nicht zu vorhandenen Einträgen zuordnet.
Einfacher wäre also gewesen, wenn du im Adressbuch die Anzeige der Threema Kontakte ausstellst. Das ist die Option, wo du einstellen/auswählen kannst von Telefon, SIM, Mailkonten, andere Konten und Threema
Hauptsache irgendwie gelöst
Das hatte ich gemacht, hat aber tatsächlich nicht funktioniert. Das hatte mich auch irritiert, aber die Sync Einstellung in Threema hat wohl die Sync Einstellung des Telefonbuchs "überstimmt". Und selektieren kann man da ja auch nicht, also z.b. "nur bekannte IDs im Telefonbuch anzeigen". Daher bin ich ganz froh, dass ich Daten nun komplett vom Handy habe. Denn jetzt wird synchronisiert und ich bekomme eine Info, so als ein Kontakt neu bei Threema ist.